阳光明媚，风平浪静，草帽海贼团的诸位正在享受着快乐时光，而就在此时，娜美却突然发起高烧，一病不起。为了治好她的病，众人扬帆来到拥有“常冬之岛”之称的医疗大国磁鼓王国。在当地人的指点下，路飞等人背着娜美上山寻找岛上唯一的魔女医生——吴羽博士。与此同时，一年前因战乱而弃国逃亡的瓦爆鲁带着邪恶的魔法师兄弟木修鲁卷土重来，他企图驱逐吴羽，重新统治这片土地。一时间战火重燃，盘桓在此的草帽海贼团被迫卷入其中……